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三代长读长技术:品评辩说蝴蝶形态等表型多样性进化妨碍

记者从中科院昆明植物钻研所患上悉,代长读长等表该地址品评辩说蝴蝶形态等表型多样性进化方面又获妨碍。技术进化

蝴蝶(凤蝶总科的品评物种统称)因其丰硕的形态多样性,自达尔文时期便作为钻研物种顺应性进化的辩说紧张类群之一,近些年更被以为是蝴蝶钻研形态遗传、进化以及发育的形态型多事实模子,已经成为发育生物学、样性进化生物学、妨碍种群遗传学、代长读长等表呵护生物学以及生态学等钻研规模的技术进化紧张方式生物之一。

凤蝶科是品评具备紧张进化位置的蝴蝶支系,其丰硕的辩说颜色以及形态等多样性是昆虫生态与进化钻研的主题。特意是蝴蝶凤蝶含有一类配合的色素规范即凤蝶色素,有助于凤蝶同党颜色多样性的形态型多组成以及种种生物学功能(如规避捕食者以及择偶)的发挥,也是样性品评辩说植物重大性状源头以及重塑的事实模子。

2015年,中国迷信院昆明植物钻研所钻研员王文团队剖析了金凤蝶(所有蝴蝶方式种)及其近缘种柑橘凤蝶基因组,并以蝴蝶为例初次实现家养昆虫的基因编纂。该所钻研团队在此根基上,为了在蝴蝶零星发育的更大尺度下品评辩说蝴蝶形态等表型多样性进化的遗传根基,2017年启动了蝴蝶谱系基因组妄想。

作为先期钻研,科研职员运用三代长读长测序技术以及Hi-C技术,剖析了扩散在东亚、南亚及西北亚且对于体色进化及物种分解具备紧张钻研意思的碧凤蝶染色体水平的基因组(首个运用Hi-C技术与三代长读长测序技术相散漫剖析的染色体水平的蝴蝶基因组)、典型冒充物种枯叶蛱蝶染色体水平的高品质基因组(首个组装W染色体的蝴蝶参考基因组)。

克日,该钻研团队运用三代长读长技术,剖析了凤蝶科两个亚科(凤蝶亚科以及绢蝶亚科)所有族的代表种类共11种凤蝶的高品质参考基因组。

散漫以前宣告的蝴蝶基因组,克制了不残缺谱系分选以及基因流等挑战,构建了族水平晃动的零星发育树。比力基因组钻研展现,位于方式基因(抉择蝴蝶同党上差距形态以及色素规范鳞片的时空定位)以及效应基因(抉择鳞片内色素分解)卑劣调控区的凤蝶科特异的非编码激进元件以及转录因子散漫位点的进化以及效应基因的快捷进化,或者增长凤蝶色素的源头与进化。

该钻研为阐释颜色多样性的基因组根基特意是凤蝶色素的源头提供了新见识,并为探究蝴蝶进化、生态学以及呵护提供了紧张的数据资源。

标签: 昆明植物 事实模子 遗传根基 数据资源

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